非標記（Label free）蛋白定量，是通過比較質譜分析次數或質譜峰強度，分析不同樣品蛋白的數量變化，通過適當的數學公式可以將質譜檢測計數與蛋白質的量聯系起來，從而對蛋白質進行定量。該技術不需要對樣品進行任何標記，每個樣品可單獨上機，樣品蛋白直接酶解后經過質譜分析產生數據，通過軟件分析后即可確定蛋白質在樣品中表達量的變化情況。
利用新一代timsTOF Pro質譜儀，通過捕獲雙TIMS（Trapped Ion Mobility Spectrometry）-離子淌度譜技術與同步累積連續碎裂（PASEF）掃描模式對樣本進行差異定量蛋白質組學研究。在傳統3D分離（保留時間、質荷比、離子強度）基礎上，增加肽段的碰撞截面積（CCS），實現4D的分離檢測。4D- Label free具有更快的速度、更高的靈敏度、更強的穩定性，可以實現檢測各種不同基質中的蛋白質，包括單細胞、血清、血漿、腦脊液和尿液等微量樣本。
實驗流程
樣品要求
細胞：5×106個細胞；動物組織：200mg；植物組織：800mg；微生物：400mg；血清血漿：300μl
非標記（Label free）蛋白定量，是通過比較質譜分析次數或質譜峰強度，分析不同樣品蛋白的數量變化，通過適當的數學公式可以將質譜檢測計數與蛋白質的量聯系起來，從而對蛋白質進行定量。該技術不需要對樣品進行任何標記，每個樣品可單獨上機，樣品蛋白直接酶解后經過質譜分析產生數據，通過軟件分析后即可確定蛋白質在樣品中表達量的變化情況。
