染色質免疫共沉淀測序（ChIP-SEQ）是指通過染色質免疫共沉淀特異性地富集目的蛋白結合的DNA片段，然后對其進行純化與文庫構建，illumina高通量測序。通過數據與參考基因組比對，peak分析，可在全基因組范圍內尋找目標蛋白特異性結合的DNA序列區段，可用于轉錄因子結合位點或組蛋白特異性修飾位點的研究。