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單細胞測序和空間轉錄組高級分析
使用與空間轉錄組來源相同或者相近的單細胞轉錄組數據,對空間中每個Spot中的細胞類型進行推測,最后會推測出空間轉錄組中的每個Spot對應單細胞細胞類型。
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Visium空間轉錄組測序
單細胞檢測技術的發展為理解組織中細胞的組成與功能提供了手段。但是,現有的方法雖能檢測到細胞類型,卻無法真實還原在組織中的空間組成位置??臻g轉錄組學技術的發展通過將傳統組織學技術的優勢與高通量RNA測序技術融合,為檢測組織中的細胞空間組成與基因表達提供了一個強有力的檢測手段。2021年Nature Methods將空間轉錄組列為2020年度技術。
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單細胞測序
單細胞測序技術被Nature Methods(2013)評為年度技術,Science(2013)評為年度六大生物類科研熱點的首位。單細胞測序技術又在 2015年登上Science轉化醫學封面。Nature Methods 將2019年年度技術又給了單細胞多組學。2013年以來基于單細胞測序技術獲得了多方面的研究進展,文獻發表也呈現迅猛增長趨勢。即使來源相同的單個細胞,由于隨機生物過程和環境擾動的原因,彼此在許多方面也存在差異,即異質性。尤其是腫瘤細胞、免疫細胞、胚胎發育期細胞、干細胞等最為突出。常規的組學技術發現不了這一現象帶來的影響,由此研究人員開啟了單細胞測序技術的探索之路。
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